Merge branch 'master' into fix_skip_count

Dockerfile

@@ -0,0 +1,38 @@
+################################################################################
+##################### Set Inital Image to work from ############################
+FROM ubuntu:16.04
+
+################################################################################
+##################### Add Container Labels #####################################
+LABEL "Regtools_License"="MIT"
+LABEL "Description"="Software package which integrate DNA-seq and RNA-seq data\
+                     to help interpret mutations in a regulatory and splicing\
+                     context."
+
+################################################################################
+##################### Install System Dependencies ##############################
+RUN apt-get update
+RUN apt-get install -y git
+RUN apt-get install -y build-essential
+RUN apt-get install -y cmake
+RUN apt-get install -y zlib1g-dev
+
+################################################################################
+##################### Install Regtools #########################################
+
+# clone git repository
+RUN git clone https://github.com/griffithlab/regtools.git
+
+# make a build directory for regtools
+WORKDIR /regtools/
+RUN mkdir build
+
+# compile from source
+RUN cd /regtools/build && cmake ..
+RUN cd /regtools/build && make
+
+################################################################################
+###################### set environment path    #################################
+
+# add regtools executable to path
+ENV PATH="/regtools/build:${PATH}"

README.md

@@ -26,6 +26,8 @@ Clone and install regtools by running:
     make
 ```
 
+For convienience we also maintain a docker image available at [https://hub.docker.com/r/griffithlab/regtools/](https://hub.docker.com/r/griffithlab/regtools/)
+
 ## Usage:
 
 ```