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Abel Hodelin Hernandez edited this page Jun 16, 2021 · 26 revisions

Dieses öffentliche Repository ist eine kursbegleitende Kollaboration von Kursteilnehmern aus dem Masterstudiengang BIDS der Graduate School Rhein-Neckar in Kooperation mit dem MIRACUM Konsortium der Medinzin-Informatik-Initiative.

Wir haben als Ziel das Bachmann-Modell als Fully Featured COMBINE Archive bereitzustellen

In dieser Wiki wird das Datamanagement für das Bachmann-Modell als Fully Featured COMBINE Archive dokumentiert.

Um das Bachmann-Modell als Fully Featured COMBINE Archive bereitzustellen, benötigen wir eine Teamarbeit. Die Arbeitsgruppen haben 2 oder 3 Mitglieder mit folgenden Aufgaben.

  • Gruppe 1: Sichtung vorhandener Materialien; Komposition des COMBINE Archives; Dokumentationstemplate; Prüfung der Zwischenergebnisse
  • Gruppe 2: Vergleich der bereitgestellten SBML-Modelle, Auswahl und Bereitstellung ausführlicher Metadaten
  • Gruppe 3: Bereitstellung des SBGN-Modells (grafische Darstellung)
  • Gruppe 4: Bereitstellung mind. eines SED-ML-Skripts (ggf. mehrere)

Die Teamarbeit der Kursmitglieder läuft unter Anleitung, Begleitung und kontinuierlicher Prüfung von Dr. Dagmar Waltemath.

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