1. 프로젝트 배경

단백질은 효소, 호르몬, 항체 등의 다양한 역할을 하기 때문에 우리의 건강의 많은 영향을 줍니다. 따라서 단백질의 기능을 밝히기 위한 연구가 활발하게 진행되고 있는데, 단백질의 기능은 단백질의 구조에 달려있으며 단백질의 구조를 알기 위해서는 단백질의 아미노산 서열을 결정하는 과정이 필요합니다.

단백질의 서열을 결정하기 위한 방법으로는 질량분석(MS)기반의 방법이 쓰입니다. 질량 분석이란 단백질을 아미노산 서열로 분해하여 데이터베이스에 존재하는 아미노산 서열과의 유사도를 분석하여 매치하는 방법입니다. 데이터베이스에 저장된 서열은 질량분석기를 통해 질량을 측정하고 질량 분석기를 통해 얻은 정보를 이용해 기존에 밝혀진, 또는 가상의 아미노산 서열입니다.

질량분석기를 통해 얻은 정보를 '스펙트럼'이라고 하며, 스펙트럼을 아미노산 서열에 매치하는 방법으로는 기존에 실험을 통해 얻은(또는 AI를 통해 예측한) 스펙트럼과 매치하는 '스펙트럼 라이브러리 서치' 방식, 임의의 서열을 이론적인 스펙트럼 정보로 만들어 매치하는 '데이터베이스 서치' 방식이 있습니다.

Devi GUI는 그 중 스펙트럼 라이브러리 서치 엔진을 쉽게 실행하고, 그 매치 결과를 시각화하여 프로테오믹스 연구자들에게 편의를 제공하는 GUI입니다.