Creación de Heatmaps

¡Les damos la bienvenida!

En este meetup aprenderemos:

• La creación de heatmaps con varias librerías de R
• Procesos de clusterización

Fecha

Jueves 16 de noviembre de 2023

Instructora

• Dra. E. Ernestina Godoy Lozano ([email protected])
• Sobre la Instructora:
  • Es la jefa del Departamento de Bioinformática en Enfermedades Infecciosas del Instituto Nacional de Salud Pública
  • Sus líneas de investigación son análisis del repertorio de anticuerpos en condiciones de salud, enfermedad y vacunación, la genómica comparativa de aislados clínicos de importancia en la salud pública, así como Metagenómica aplicada a enfermedades infecciosas.

Materiales

• Para descargar este repositorio, da click en el botón Code > Download zip.

Si lo prefieres, puedes usar el comando git clone < url_repositorio > desde tu terminal para clonar el repositorio.

Conocimientos previos requeridos

Para aprovechar al máximo este Meetup, se recomienda tener conocimientos básicos de R y RStudio.

Requerimientos de software

• Tener instalado R >= 4.0
• Tener instalado RStudio >= 1.4

Librerías instaladas

ggplot2, gplots, vegan, reshape2, circlize, ComplexHeatmap, Heatplus

Pueden instalarlas con las siguientes instrucciones:

• CRAN
  • install.packages("ggplot2")
  • install.packages("gplots")
  • install.packages("vegan")
  • install.packages("reshape2")
  • install.packages("circlize")
  • install.packages("BiocManager")
• Bioconductor
  • BiocManager::install("ComplexHeatmap")
  • BiocManager::install("Heatplus")

Código de Conducta

Recuerda leer y atender nuestro código de conducta disponible en https://rladies.org/code-of-conduct/ o https://rladiesmx.netlify.app/codigo_de_conducta/

Patrocinadores

Agradecemos a nuestros patrocinadores: Red Mexicana de Bioinformática y al Instituto de Biotecnología