Remove stashed files and convert notebooks to scripts (#186)

@DanielTollenaar can the stash folder be removed now? See
8d13795

4aa3ee1 converts the remaining
notebooks just like in #171.

notebooks/ijsselmeermodel/brongegevens.py

@@ -0,0 +1,11 @@
+import os
+from pathlib import Path
+
+import geopandas as gpd
+
+DATA_DIR = os.getenv("RIBASIM_NL_DATA_DIR")
+
+# file-paths
+kunstwerken_gpkg = Path(DATA_DIR) / "nl_kunstwerken.gpkg"
+
+kunstwerken_gdf = gpd.read_file(kunstwerken_gpkg)

notebooks/nl-kunstwerken.py

@@ -0,0 +1,102 @@
+import os
+from pathlib import Path
+
+import geopandas as gpd
+import pandas as pd
+import requests
+from shapely.geometry import Point
+
+# # Voorbereiding
+#
+# Globale variabelen
+# `DATA_DIR`: De locale directory waar project-data staat opgeslagen
+# `EXCEL_FILE`: Het Excel-bestand dat moet worden ingelezen
+# `CRS`: De projectile waarin de ruimtelijke data moet worden opgeslagen (28992 = Rijksdriehoekstelsel)
+
+
+# environmnt variables
+DATA_DIR = os.getenv("RIBASIM_NL_DATA_DIR")
+RIBASIM_NL_CLOUD_PASS = os.getenv("RIBASIM_NL_CLOUD_PASS")
+assert DATA_DIR is not None
+assert RIBASIM_NL_CLOUD_PASS is not None
+
+EXCEL_FILE = r"# Overzicht kunstwerken primaire keringen waterschappen_ET.xlsx"
+CRS = 28992
+RIBASIM_NL_CLOUD_USER = "nhi_api"
+WEBDAV_URL = "https://deltares.thegood.cloud/remote.php/dav"
+BASE_URL = f"{WEBDAV_URL}/files/{RIBASIM_NL_CLOUD_USER}/D-HYDRO modeldata"
+
+# file-paths
+kunstwerken_xlsx = Path(DATA_DIR) / EXCEL_FILE
+kunstwerken_gpkg = kunstwerken_xlsx.parent / "nl_kunstwerken.gpkg"
+
+
+def upload_file(url, path):
+    with open(path, "rb") as f:
+        r = requests.put(url, data=f, auth=(RIBASIM_NL_CLOUD_USER, RIBASIM_NL_CLOUD_PASS))
+    r.raise_for_status()
+
+
+# ## Inlezen NL kunstwerken vanuit data dir
+# We lezen de geleverde excel in en:
+# - skippen de eerste 6 regels boven de header
+# - gooien, voor dit project, irrelevante kolommen weg
+# - hernoemen de kolom met organisatie-naam, x en y coordinaat
+# - transformeren de x en y coordinaat; wordt NaN wanneer data dat niet toelaat (text of missend)
+
+
+# skip first rows
+kunstwerken_df = pd.read_excel(kunstwerken_xlsx, skiprows=6)
+
+# drop irrelevant columns
+columns = kunstwerken_df.columns[1:13]
+kunstwerken_df = kunstwerken_df.loc[:, columns]
+
+# rename columns into our liking
+kunstwerken_df.rename(
+    columns={
+        "Unnamed: 1": "organisatie",
+        "Y coördinaat RD": "y",
+        "X coördinaat RD": "x",
+    },
+    inplace=True,
+)
+
+# drop no-data rows
+kunstwerken_df = kunstwerken_df[~kunstwerken_df["organisatie"].isna()]
+
+# convert x/y to numeric
+kunstwerken_df["x"] = pd.to_numeric(kunstwerken_df["x"], errors="coerce")
+kunstwerken_df["y"] = pd.to_numeric(kunstwerken_df["y"], errors="coerce")
+
+
+# ## Aanmaken niet-ruimtelijke table
+# Waar x/y coordinaten mizzen maken we een niet-ruimtelijke table die we wegschrijven in geen GeoPackage
+
+
+# make a non-spatial GeoDataFrame where x/y are missing
+kunstwerken_non_spatial_df = kunstwerken_df[kunstwerken_df["x"].isna() | kunstwerken_df["y"].isna()]
+kunstwerken_non_spatial_gdf = gpd.GeoDataFrame(kunstwerken_non_spatial_df, geometry=gpd.GeoSeries(), crs=28992)
+
+# writ to GeoPackage
+kunstwerken_non_spatial_gdf.to_file(kunstwerken_gpkg, layer="kunstwerken (geen coordinaten)")
+
+
+# ## Aanmaken ruimtelijke table
+# Waar x/y coordinaten beschikbaar zijn maken we een ruimtelijke table die we wegschrijven in geen GeoPackage
+
+
+# make a spatial GeoDataFrame where x/y exist
+kunstwerken_spatial_df = kunstwerken_df[~kunstwerken_df["x"].isna() & ~kunstwerken_df["y"].isna()]
+geometry_series = gpd.GeoSeries(kunstwerken_spatial_df.apply((lambda x: Point(x.x, x.y)), axis=1))
+kunstwerken_spatial_gdf = gpd.GeoDataFrame(kunstwerken_spatial_df, geometry=geometry_series, crs=CRS)
+
+# write to GeoPackage
+kunstwerken_spatial_gdf.to_file(kunstwerken_gpkg, layer="kunstwerken")
+
+
+# ## Upload geopackage
+
+
+to_url = f"{BASE_URL}/Rijkswaterstaat/{kunstwerken_gpkg.name}"
+upload_file(to_url, kunstwerken_gpkg)