fix: typing of cli arguments

analysis.md

@@ -0,0 +1,71 @@
+
+# PASSED: **ID:** 'C001', **Name:** 'class-definition', **Pattern:** './/ClassDef', min=1, max=None
+
+    - /_scratch/chasten/chasten/enumerations.py - 3 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/results.py - 6 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/server.py - 1 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/constants.py - 10 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/debug.py - 2 matches
+
+# PASSED: **ID:** 'F001', **Name:** 'all-function-definition', **Pattern:** './/FunctionDef', min=1, max=None
+
+    - /_scratch/chasten/tests/test_filesystem.py - 16 matches
+    - /_scratch/chasten/tests/test_util.py - 5 matches
+    - /_scratch/chasten/tests/test_main.py - 18 matches
+    - /_scratch/chasten/tests/test_configuration.py - 3 matches
+    - /_scratch/chasten/tests/test_checks.py - 8 matches
+    - /_scratch/chasten/tests/test_validate.py - 4 matches
+    - /_scratch/chasten/tests/test_debug.py - 8 matches
+    - /_scratch/chasten/tests/test_process.py - 3 matches
+    - /_scratch/chasten/tests/test_constants.py - 5 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/database.py - 6 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/server.py - 2 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/util.py - 8 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/main.py - 10 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/process.py - 4 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/output.py - 12 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/checks.py - 9 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/validate.py - 4 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/configuration.py - 10 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/filesystem.py - 12 matches
+
+# PASSED: **ID:** 'F002', **Name:** 'dummy-test-non-test-function-definition', **Pattern:** './/FunctionDef\[not(contains(@name, "test_"))]', min=None, max=None
+
+    - /_scratch/chasten/tests/test_main.py - 1 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/database.py - 6 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/server.py - 2 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/util.py - 8 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/main.py - 10 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/process.py - 4 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/output.py - 10 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/checks.py - 9 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/validate.py - 4 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/configuration.py - 10 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/filesystem.py - 12 matches
+
+# PASSED: **ID:** 'CL001', **Name:** 'dummy-test-single-nested-if', **Pattern:** './/FunctionDef/body//If', min=None, max=None
+
+    - /_scratch/chasten/tests/test_filesystem.py - 1 matches
+    - /_scratch/chasten/tests/test_util.py - 1 matches
+    - /_scratch/chasten/tests/test_checks.py - 1 matches
+    - /_scratch/chasten/tests/test_process.py - 1 matches
+    - /_scratch/chasten/tests/test_constants.py - 1 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/database.py - 12 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/util.py - 4 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/main.py - 26 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/process.py - 5 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/output.py - 7 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/checks.py - 13 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/validate.py - 3 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/configuration.py - 15 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/filesystem.py - 11 matches
+
+# PASSED: **ID:** 'CL002', **Name:** 'dummy-test-double-nested-if', **Pattern:** './/FunctionDef/body//If\[ancestor::If and not(parent::orelse)]', min=None, max=None
+
+    - /_scratch/chasten/chasten/database.py - 4 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/main.py - 8 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/output.py - 1 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/checks.py - 3 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/validate.py - 1 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/configuration.py - 3 matches
+    - /_scratch/chasten/chasten/filesystem.py - 3 matches

chasten/main.py

@@ -261,7 +261,7 @@ def analyze(  # noqa:  PLR0912, PLR0913, PLR0915
         writable=True,
         resolve_path=True,
     ),
-    config: Path = typer.Option(
+    config: str = typer.Option(
         None,
         "--config",
         "-c",