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tutorial_01_run_jupyter_notebook.md

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実習の説明

AJACS68 (AJACS浜松) https://events.biosciencedbc.jp/training/ajacs68
January 17, 2018

尾崎 遼
Haruka Ozaki
[email protected] | http://yuifu.github.io | @yuifu

理化学研究所 情報基盤センター バイオインフォマティクス研究開発ユニット 基礎科学特別研究員
Bioinformatics Research Unit, ACCC, RIKEN


概要

この文章では実習について説明します。実習用環境の準備が終わっていることを前提とします。

実習用資料: https://github.com/yuifu/ajacs68



実習用環境の簡単な説明

Jupyter notebook はRを使うインターフェースの一つです。JupyterHubはたくさんのユーザに統一的なJupyter notebookの実行環境を提供するサーバーです。

Jupyter notebook を開く

ChromeでJupyter notebook のホーム画面を開いた状態にしてください。

ajacs68 のディレクトリ内に移動します。ajacs68をクリックしてください。

下図のようなファイル一覧が表示されます。

notebook_001_tumor_communication.ipynbをクリックします。下図のようなタブが表示されれば成功です。