1j_CalculateHeterozygosity.py

__author__ = 'jgwall'

import argparse

debug = False


def main():
    args = parse_args()


def parse_args():
    parser = argparse.ArgumentParser()
    parser.add_argument("-i", "--infile")
    parser.add_argument("--debug", default=False, action="store_true")
    args = parser.parse_args()

    # Handle debug flag
    global debug
    debug = args.debug

    return parser.parse_args()


if __name__ == '__main__': main()