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2018년 12월 31일 ~ 2019년 2월 22일

Internship

  • 회사 업무, 개인 프로젝트, 팀 프로젝트 수행

2018년 12월 27일

Workshop

  • WGS/WES Pipeline in Docker
  • Microbiome
  • Deep Learning in Medical Image Analysis
  • Overview of research and clinical applications of pharmacogenetics and genomics
  • An introduction to clinical informatics: elements and concepts

2018년 12월 26일

Workshop

  • 단백질 구조연구
  • Somatic mutations signatures
  • Differential Expression Analysis using edgeR
  • PyQT5를 이용한 Fastqc 프로그램 만들기

2018년 12월 24일

Internship

  • OT

2018년 12월 21일

Special Lecture

이계화 (서울대학교병원 정밀의료센터)

  • NGS BASIC 2
  • Cancer Genomics

손경아 (아주대학교 소프트웨어학과)

  • Machine Learning for Biomedical Informatics

2018년 12월 20일

Special Lecture

박유랑 (연세대학교 의과대학 의생명시스템정보학교실)

  • 보건의료정보

손경아 (아주대학교 소프트웨어학과)

  • Machine Learning for Biomedical Informatics

2018년 12월 19일

NGS

김대승 (테라젠이텍스 바이오연구소)

  • Epigenomics 분석 및 실습

2018년 12월 18일

Special Lecture

이계화 (서울대학교병원 정밀의료센터)

  • NGS BASIC 1

Company Visit

  • 테라젠이텍스 바이오연구소

2018년 12월 17일

Special Lecture

장동진 (여의도성모병원 안과)

  • 제약 산업정책의 이해
  • 보건의료 데이터를 활용한 임상 연구 사례
  • Framework for FDA's RWE Program

Company Visit

  • Thermo Fisher Scientific

2018년 12월 15일 ~ 16일

Hackathon


2018년 12월 14일

Special Lecture

송영수 (한양대학교 생명의료정보학과)

  • Clinical Application of NGS in Oncology

신현정 (아주대학교 산업공학과)

  • Machine Learning for BioMedical Informaticians

2018년 12월 13일

Special Lecture

윤덕용 (아주대학교 의과대학 의료정보학과)

  • 임상 빅데이터 연구사례

Company Visit

  • 녹십자지놈

2018년 12월 12일

NGS

백인표 (테라젠이텍스 바이오연구소)

  • Single Cell RNA-Seq

2018년 12월 10일

Web

이재학, 김병준 (Syntekabio)

  • Analysis of Variant Difference within Ethnic Groups

2018년 12월 7일

Special Lecture

김헌성 (가톨릭대학교 의료정보학교실)

  • Waht is Real-World-Evidence?
  • Patient-Generated Health Data From Digital Healthcare
  • Clinical Experiences of EMR-based clinical Research

신현정 (아주대학교 산업공학과)

  • Machine Learning for BioMedical Informaticians

2018년 12월 6일

Special Lecture

이영희 (유타대학교 생명의료정보학과)

  • Practical Overview of RNA-Seq Analysis Tools

이수연 (한국기초과학지원연구원)

  • Introduction to Big Data by NGS
  • Precision Medicine based on Bio-big data with AI

2018년 12월 5일

NGS

유승일 (테라젠이텍스 바이오연구소)

  • RNA-Seq 분석 실습

2018년 12월 4일

Project Presentation

  • Deep Cognition 을 사용한 WideResNet 기반 Brest Cancer deep learning& iris flowers dataset study
  • Relationship between Chemical structures and Genomic features
  • GATK Best Practice and File Parsing
  • RETAIN: An Interpretable Predictive Model for Healthcare using Reverse Time Attention Mechanism

Special Lecture

한미령 (고려대학교 의과대학)

  • Exome Sequencing Analysis in Clinical Research

2018년 12월 3일

Web

이재학, 김병준 (Syntekabio)

  • Creation and Analysis of Protein Multiple Sequence Alignment

2018년 11월 30일

Company Visit

  • Cipherome
  • DNA Link

2018년 11월 29일

Special Lecture

한미령 (고려대학교 의과대학)

  • GWAS 실습

이수현 (건양대학교 의과대학 정보의학교실)

  • Biomedical Informatics & EMR based Clinical Research Informatics

2018년 11월 28일

NGS

홍성의 (테라젠이텍스 바이오연구소)

  • WGS/WES 분석 개론

2018년 11월 27일

Project Presentation

  • 2종류의 Cancer data 분류모델 및 모델검증
  • Breast cancer의 예후와 특정 gene 변이의 연관성
  • protein protein interaction based combination drug
  • Biopython

Company Visit

  • ChunLab, Inc.

2018년 11월 26일

Microbiome

윤석환 (ChunLab, Inc.)

  • 미생물 유전체 및 전사체 생물정보 분석

2018년 11월 23일

Company Visit

  • Syntekabio
  • Pharos iBT

2018년 11월 22일

Special Lecture

이영희 (유타대학교 생명의료정보학과)

  • Knowledge-driven multi-omics data integration

강근수 (단국대학교)

  • 전사체 빅데이터 기초 및 응용

2018년 11월 21일

NGS

박신기 (테라젠이텍스 바이오연구소)

  • Whole Genome de novo 분석 및 실습

2018년 11월 20일

Project Presentation

  • VCF File and Its Visualization
  • Exploratory Research: What is oral cancer?
  • Response-MOA-Structure Based Drug Discovery
  • Filtering VCF File of Pfeiffier Syndrome
  • Whole Exome Sequencing Data Analysis

Company Visit

  • 미소정보기술

2018년 11월 19일

Microbiome

김병용, 윤석환 (ChunLab, Inc.)

  • NGS를 활용한 microbiome 연구방법론 및 연구 동향
  • BIOiPLUG와 EzBioCloud를 활용한 microbiome 분석 실습

2018년 11월 16일

DeepLearning

김종수 (테란젠이텍스 바이오연구소)

  • Implemeting DNN Using Tensorflow

2018년 11월 15일

Special Lecture

한미령 (고려대학교 의과대학)

  • Understanding Genome-Wide Association Studies

박지연 (가톨릭대학교 의과대학)

  • Bioinformatic Analysis of Posttranscriptional Regulation

2018년 11월 14일

NGS

서채화, 김종민 (DNA Link)

  • RNA-Seq Data Analysis

2018년 11월 13일

R

서울대학교 생명정보학과 김주한 교수님 연구실

  • Microarray Data Analysis
  • Association of BRCA1 and BRCA2 mutations with survival in ovarian cancer, 2011, JAMA

2018년 11월 12일

R

서울대학교 생명정보학과 김주한 교수님 연구실

  • Statistical Analysis with Biomedical Data

2018년 11월 9일

DeepLearning

소재우 (테란젠이텍스 바이오연구소)

  • Implemeting DNN Using Numpy and Tensorflow

2018년 11월 8일

Special Lecture

한현욱 (차의과학대학교 의학전문대학원 정보의학교실)

  • Blockchain & Healthcarebigdata

Special Lecture

정제균 (삼성유전체연구소)

  • 유전체 빅데이터 현황 및 응용 사례

2018년 11월 7일

NGS

박민영 (DNA Link)

  • VCF 기반 분석 기법

2018년 11월 6일

Special Lecture

박근준 (Thermo Fisher Scientific)

  • Ion Torrent NGS Sequencer Precision Medicine

유회숙, 김주현 (Thermo Fisher Scientific)

  • Real Time PCR 원리와 실습
  • 다양한 어플리케이션 소개

2018년 11월 5일

Python

서울대학교 생명정보학과 김주한 교수님 연구실

  • Medical Informatics Practice
  • VGG16 Model for Binary Classification (Skin melanoma / Bowen's disease)

2018년 11월 2일

DeepLearning

소재우 (테란젠이텍스 바이오연구소)

  • Tensorflow Basic

2018년 11월 1일

Python

서울대학교 생명정보학과 김주한 교수님 연구실

  • Bioinformatics Practice

2018년 10월 31일

NGS

박민영 (DNA Link)

  • NGS 분석 및 활용 & 유전체 데이터의 Annotation

2018년 10월 30일

Special Lecture

박근준 (Thermo Fisher Scientific)

  • 회사 소개
  • NGS 기술 소개
  • 예방의학, DTC 유전자 검사 산업의 동향

박미경 (Thermo Fisher Scientific MA TSS)

  • 회사 소개
  • Microarray Overview & Application

2018년 10월 29일

Web

이선호 (Syntekabio)

  • Genome Wide Association Study

2018년 10월 26일

DeepLearning

소재우 (테란젠이텍스 바이오연구소)

  • Tensorflow Basic

2018년 10월 25일

Web

설재민 (Syntekabio BI)

  • Deep Learning based patient stratification

Special Lecture

김지훈 (녹십자지놈)

  • 회사 소개
  • 유전체 정밀의학 산업

이병철 (마크로젠)

  • 회사 소개

2018년 10월 24일

NGS

박민영, 이승재 (DNA Link)

  • NGS 관련 data format에 대한 이해 및 NGS 분석 및 활용
  • 동식물 유전체 조합 분석의 이해 2

2018년 10월 23일

Web

김영조, Peter (Syntekabio)

  • Chemical Project

2018년 10월 22일

Web

이선호 (Syntekabio)

  • Variant Calling Algorithm & Application

Special Lecture

최경환 (EONE-DIAGNOMICS Genome Center 전략기획팀)

  • 회사소개
  • 유전체 기반 플랫폼 비즈니스

2018년 10월 19일

DeepLearning

소재우 (테란젠이텍스 바이오연구소)

  • Tensorflow Basic

2018년 10월 18일

Web

김영조, Peter (Syntekabio)

  • Protein Project

2018년 10월 17일

NGS

이승재 (DNA Link)

  • NGS 분석의 이해
  • 동식물 유전체 조립 분석의 이해 1

2018년 10월 16일

Web

김영조, Peter (Syntekabio)

  • Variant Calling Algorithm 실습

Special Lecture

김병용, 김경아 (ChunLab, Inc.)

  • 회사소개
  • Second Genome: Microbiome
  • Web Based Analysis Tool for Microbiology

2018년 10월 15일

Special Lecture

정종선 (Syntekabio CEO)

  • 회사소개
  • 유전체 빅데이터 및 알고리즘 기반 비즈니스

Web

김영조, Peter (Syntekabio)

  • Somatic & Germline Variant Calling Algorithm

2018년 10월 12일

R

박민영 (DNA Link)

  • 시각화

2018년 10월 11일

Qlik Sense

강정용 (미소정보기술)

  • Dashboard 작성 심화
  • Script

2018년 10월 10일

Qlik Sense

강정용 (미소정보기술)

  • Dashboard 작성 기본
  • Extensions 사용

2018년 10월 8일

R

박민영 (DNA Link)

  • Data Manipulation

2018년 10월 5일

R

박민영 (DNA Link)

  • R 기본

Special Lecture

박근준 (Thermo Fisher Scientific)

  • 회사소개

김태형 (테란젠이텍스 바이오연구소)

  • 회사소개
  • 유전체 산업현황과 전망

2018년 10월 4일

R

박민영 (DNA Link)

  • R 기본

Special Lecture

이종은, 김숙, 김수연 (DNA Link)

  • 회사소개
  • 유전체기반 맞춤의학 전문 헬스케어

2018년 10월 2일

SQL

정정임 (미소정보기술)

  • PostgreSQL 응용

2018년 10월 1일

SQL

정정임 (미소정보기술)

  • PostgreSQL 고급

2018년 9월 28일

SQL

정정임 (미소정보기술)

  • PostgreSQL 기초
  • Qilk 소개

Special Lecture

남기엽 (Pharos iBT)

  • 회사 소개
  • 인공지능신약개발시스템

인용호 (Cipherome)

  • 회사 소개
  • 개인의 유전자 데이터에 의한 맞춤형 약물 적합성 솔루션

김주한 (서울대학교 의과대학 시스템바이오정보의학센터장)

  • Precision Dinner for my Genomes and Personal Health Records

2018년 9월 27일

SQL

정정임 (미소정보기술)

  • PostgreSQL 개요 및 기초
  • 회사 소개

2018년 9월 21일

Python

김종수 (테라젠이텍스 바이오연구소)

  • 생물 정보학 프로그래밍

2018년 9월 20일

Amazon Web Services

장석재 (AWS)

  • network 설명
  • AWS 101 Hands on Lab

2018년 9월 19일

Amazon Web Services

이재철 (AWS)

  • AWS 101 세미나

장석재 (AWS)

  • EC2 (Instance, ELB, AutoScaling)

2018년 9월 18일

Python

김종수 (테라젠이텍스 바이오연구소)

  • Regular Expression
  • 생물 정보학 프로그래밍

2018년 9월 17일

Python

김종수 (테라젠이텍스 바이오연구소)

  • Python Basic

2018년 9월 14일

Python

김종수 (테라젠이텍스 바이오연구소)

  • Python 개요
  • Linux Server에서 Python 분석 환경 설정

2018년 9월 13일

Linux

진재욱 (테라젠이텍스 바이오연구소)

  • 사용자 관련 명령어
  • VI/VIM 명령어
  • Shell Script 작성
  • 분석 시스템 설정

2018년 9월 12일

Linux

진재욱 (테라젠이텍스 바이오연구소)

  • Ubuntu 시스템 명령어

2018년 9월 11일

Linux

진재욱 (테라젠이텍스 바이오연구소)

  • Ubuntu 기본 명령어

2018년 9월 10일

Special Lecture

김주한 (서울대학교 의과대학 시스템바이오정보의학센터장)

  • OT

이근우 (한국생명정보학회장, 경상대학교 생명과학부)

  • Introduction to Structural Bioinformatics (Molecular Modeling) and Computer-Aided Drug Design (CADD)

Linux

진재욱 (테라젠이텍스 바이오연구소)

  • Linux 개요 및 Ubuntu 설치