From aa6cd26b4b46842d742d760ebc18653afe204586 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: elodiegermani1 <elodie.germani@irisa.fr>
Date: Wed, 21 Feb 2024 13:50:45 +0100
Subject: [PATCH] Publication update

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@@ -55,7 +55,6 @@ <h2 id="title" class="italic">PhD student</h2>
          <dt class="ChampRes">titre</dt><dd class="ValeurRes Titre"><a href="https://inria.hal.science/hal-03769993v6" target="_blank" >On the benefits of self-taught learning for brain decoding</a></dd>
          <dt class="ChampRes">auteur</dt><dd class="ValeurRes Auteurs">Elodie Germani, Elisa Fromont, Camille Maumet</dd>
          <dt class="ChampRes">article</dt><dd class="ValeurRes article"><i>GigaScience</i>, 2023, 12, pp.1-17. <a target="_blank" href="https://dx.doi.org/10.1093/gigascience/giad029">&#x27E8;10.1093/gigascience/giad029&#x27E9;</a></dd>
-         <dt class="ChampRes">DOI</dt><dd class="ValeurRes DOI">DOI : <a href="//dx.doi.org/10.1093/gigascience/giad029" target="_blank" >10.1093/gigascience/giad029</a></dd>
          <dt class="ChampRes">Accès au texte intégral et bibtex</dt>
          <dd class="ValeurRes Fichier_joint">
          <a href="https://inria.hal.science/hal-03769993/file/on_the_benefits_of_self_taught_learning.pdf"  target="_blank">
@@ -64,28 +63,17 @@ <h2 id="title" class="italic">PhD student</h2>
          <img alt="BibTex" src="https://haltools.archives-ouvertes.fr/images/Haltools_bibtex3.png" border="0"  title="BibTex" /></a>
          </span></dd>
          </dl>
-         <p class='SousRubrique'>Poster communications</p>
-         <dl class='NoticeRes'>
-         <dt class="ChampRes">titre</dt><dd class="ValeurRes Titre"><a href="https://inria.hal.science/hal-03991042" target="_blank" >Exploring variability patterns in the task-fMRI analytical space</a></dd>
-         <dt class="ChampRes">auteur</dt><dd class="ValeurRes Auteurs">Elodie Germani, Elisa Fromont, Camille Maumet</dd>
-         <dt class="ChampRes">article</dt><dd class="ValeurRes article"><i>OHBM 2023 - 29th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping</i>, Jul 2023, Montreal, Canada</dd>
-         <dt class="ChampRes">Accès au texte intégral et bibtex</dt>
-         <dd class="ValeurRes Fichier_joint">
-         <a href="https://inria.hal.science/hal-03991042/file/abstract_OHBM.pdf"  target="_blank">
-         <img alt="https://inria.hal.science/hal-03991042/file/abstract_OHBM.pdf" src="https://haltools.archives-ouvertes.fr/images/Haltools_pdf.png" border="0" title="https://inria.hal.science/hal-03991042/file/abstract_OHBM.pdf" /></a>
-         <span class="LienBibtexACoteFulltext"><a href="https://inria.hal.science/hal-03991042/bibtex" target="_self">
-         <img alt="BibTex" src="https://haltools.archives-ouvertes.fr/images/Haltools_bibtex3.png" border="0"  title="BibTex" /></a>
-         </span></dd>
-         </dl>
+         <p class='SousRubrique'>Submitted papers</p>
          <dl class='NoticeRes'>
-         <dt class="ChampRes">titre</dt><dd class="ValeurRes Titre"><a href="https://inria.hal.science/hal-04068797" target="_blank" >Representation learning for more reproducible fMRI data analyses</a></dd>
+         <dt class="ChampRes">titre</dt><dd class="ValeurRes Titre"><a href="https://hal.science/hal-04331232v2" target="_blank" >Uncovering communities of pipelines in the task-fMRI analytical space</a></dd>
          <dt class="ChampRes">auteur</dt><dd class="ValeurRes Auteurs">Elodie Germani, Elisa Fromont, Camille Maumet</dd>
-         <dt class="ChampRes">article</dt><dd class="ValeurRes article"><i>IABM 2023 - Colloque Français d'Intelligence Artificielle en Imagerie Biomédical</i>, Mar 2023, Paris, France. pp.1</dd>
+         <dt class="ChampRes">article</dt><dd class="ValeurRes article">2024</dd>
+         <dt class="ChampRes">article</dt><dd class="ValeurRes article"><i>Paper submitted to ICIP 2024.</i></dd>
          <dt class="ChampRes">Accès au texte intégral et bibtex</dt>
          <dd class="ValeurRes Fichier_joint">
-         <a href="https://inria.hal.science/hal-04068797/file/poster_elodiegermani.pdf"  target="_blank">
-         <img alt="https://inria.hal.science/hal-04068797/file/poster_elodiegermani.pdf" src="https://haltools.archives-ouvertes.fr/images/Haltools_pdf.png" border="0" title="https://inria.hal.science/hal-04068797/file/poster_elodiegermani.pdf" /></a>
-         <span class="LienBibtexACoteFulltext"><a href="https://inria.hal.science/hal-04068797/bibtex" target="_self">
+         <a href="https://hal.science/hal-04331232v2/file/icip2024-germ.pdf"  target="_blank">
+         <img alt="https://hal.science/hal-04331232v2/file/icip2024-germ.pdf" src="https://haltools.archives-ouvertes.fr/images/Haltools_pdf.png" border="0" title="https://hal.science/hal-04331232v2/file/icip2024-germ.pdf" /></a>
+         <span class="LienBibtexACoteFulltext"><a href="https://hal.science/hal-04331232v2/bibtex" target="_self">
          <img alt="BibTex" src="https://haltools.archives-ouvertes.fr/images/Haltools_bibtex3.png" border="0"  title="BibTex" /></a>
          </span></dd>
          </dl>
@@ -94,7 +82,6 @@ <h2 id="title" class="italic">PhD student</h2>
          <dt class="ChampRes">titre</dt><dd class="ValeurRes Titre"><a href="https://inserm.hal.science/inserm-04356768" target="_blank" >The HCP multi-pipeline dataset: an opportunity to investigate analytical variability in fMRI data analysis</a></dd>
          <dt class="ChampRes">auteur</dt><dd class="ValeurRes Auteurs">Elodie Germani, Elisa Fromont, Pierre Maurel, Camille Maumet</dd>
          <dt class="ChampRes">article</dt><dd class="ValeurRes article">2023</dd>
-         <dt class="ChampRes">article</dt><dd class="ValeurRes article"><i>Paper and data in submission.</i></dd>
          <dt class="ChampRes">Accès au texte intégral et bibtex</dt>
          <dd class="ValeurRes Fichier_joint">
          <a href="https://inserm.hal.science/inserm-04356768/file/main.pdf"  target="_blank">
@@ -104,15 +91,51 @@ <h2 id="title" class="italic">PhD student</h2>
          </span></dd>
          </dl>
          <dl class='NoticeRes'>
-         <dt class="ChampRes">titre</dt><dd class="ValeurRes Titre"><a href="https://hal.science/hal-04331232" target="_blank" >Uncovering communities of pipelines in the task-fMRI analytical space</a></dd>
+         <dt class="ChampRes">titre</dt><dd class="ValeurRes Titre"><a href="https://inserm.hal.science/inserm-04465765" target="_blank" >Predicting Parkinson's disease trajectory using clinical and functional MRI features: a reproduction and replication study</a></dd>
+         <dt class="ChampRes">auteur</dt><dd class="ValeurRes Auteurs">Elodie Germani, Nikhil Baghwat, Mathieu Dugré, Rémi Gau, Albert Montillo, Kevin Nguyen, Andrzej Sokolowski, Madeleine Sharp, Jean-Baptiste Poline, Tristan Glatard</dd>
+         <dt class="ChampRes">article</dt><dd class="ValeurRes article">2024</dd>
+         <dt class="ChampRes">Accès au texte intégral et bibtex</dt>
+         <dd class="ValeurRes Fichier_joint">
+         <a href="https://inserm.hal.science/inserm-04465765v1/file/main.pdf"  target="_blank">
+         <img alt="https://inserm.hal.science/inserm-04465765v1/file/main.pdf" src="https://haltools.archives-ouvertes.fr/images/Haltools_pdf.png" border="0" title="https://inserm.hal.science/inserm-04465765v1/file/main.pdf" /></a>
+         <span class="LienBibtexACoteFulltext"><a href="https://inserm.hal.science/inserm-04465765v1/bibtex" target="_self">
+         <img alt="BibTex" src="https://haltools.archives-ouvertes.fr/images/Haltools_bibtex3.png" border="0"  title="BibTex" /></a>
+         </span></dd>
+         </dl>
+         <dl class='NoticeRes'>
+         <dt class="ChampRes">titre</dt><dd class="ValeurRes Titre"><a href="https://inserm.hal.science/inserm-04466478" target="_blank" >On the validity of fMRI studies with subject-level data processed through different pipelines</a></dd>
+         <dt class="ChampRes">auteur</dt><dd class="ValeurRes Auteurs">Elodie Germani, Xavier Rolland, Pierre Maurel, Camille Maumet</dd>
+         <dt class="ChampRes">article</dt><dd class="ValeurRes article">2024</dd>
+         <dt class="ChampRes">Accès au texte intégral et bibtex</dt>
+         <dd class="ValeurRes Fichier_joint">
+         <a href="https://inserm.hal.science/inserm-04466478v1/file/template.pdf"  target="_blank">
+         <img alt="https://inserm.hal.science/inserm-04466478v1/file/template.pdf" src="https://haltools.archives-ouvertes.fr/images/Haltools_pdf.png" border="0" title="https://inserm.hal.science/inserm-04466478v1/file/template.pdf" /></a>
+         <span class="LienBibtexACoteFulltext"><a href="https://inserm.hal.science/inserm-04466478v1/bibtex" target="_self">
+         <img alt="BibTex" src="https://haltools.archives-ouvertes.fr/images/Haltools_bibtex3.png" border="0"  title="BibTex" /></a>
+         </span></dd>
+         </dl>
+         <p class='SousRubrique'>Poster communications</p>
+         <dl class='NoticeRes'>
+         <dt class="ChampRes">titre</dt><dd class="ValeurRes Titre"><a href="https://inria.hal.science/hal-03991042" target="_blank" >Exploring variability patterns in the task-fMRI analytical space</a></dd>
          <dt class="ChampRes">auteur</dt><dd class="ValeurRes Auteurs">Elodie Germani, Elisa Fromont, Camille Maumet</dd>
-         <dt class="ChampRes">article</dt><dd class="ValeurRes article">2023</dd>
-         <dt class="ChampRes">article</dt><dd class="ValeurRes article"><i>Paper submitted to ICIP 2024.</i></dd>
+         <dt class="ChampRes">article</dt><dd class="ValeurRes article"><i>OHBM 2023 - 29th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping</i>, Jul 2023, Montreal, Canada</dd>
          <dt class="ChampRes">Accès au texte intégral et bibtex</dt>
          <dd class="ValeurRes Fichier_joint">
-         <a href="https://hal.science/hal-04331232/file/conference_101719.pdf"  target="_blank">
-         <img alt="https://hal.science/hal-04331232/file/conference_101719.pdf" src="https://haltools.archives-ouvertes.fr/images/Haltools_pdf.png" border="0" title="https://hal.science/hal-04331232/file/conference_101719.pdf" /></a>
-         <span class="LienBibtexACoteFulltext"><a href="https://hal.science/hal-04331232/bibtex" target="_self">
+         <a href="https://inria.hal.science/hal-03991042/file/abstract_OHBM.pdf"  target="_blank">
+         <img alt="https://inria.hal.science/hal-03991042/file/abstract_OHBM.pdf" src="https://haltools.archives-ouvertes.fr/images/Haltools_pdf.png" border="0" title="https://inria.hal.science/hal-03991042/file/abstract_OHBM.pdf" /></a>
+         <span class="LienBibtexACoteFulltext"><a href="https://inria.hal.science/hal-03991042/bibtex" target="_self">
+         <img alt="BibTex" src="https://haltools.archives-ouvertes.fr/images/Haltools_bibtex3.png" border="0"  title="BibTex" /></a>
+         </span></dd>
+         </dl>
+         <dl class='NoticeRes'>
+         <dt class="ChampRes">titre</dt><dd class="ValeurRes Titre"><a href="https://inria.hal.science/hal-04068797" target="_blank" >Representation learning for more reproducible fMRI data analyses</a></dd>
+         <dt class="ChampRes">auteur</dt><dd class="ValeurRes Auteurs">Elodie Germani, Elisa Fromont, Camille Maumet</dd>
+         <dt class="ChampRes">article</dt><dd class="ValeurRes article"><i>IABM 2023 - Colloque Français d'Intelligence Artificielle en Imagerie Biomédical</i>, Mar 2023, Paris, France. pp.1</dd>
+         <dt class="ChampRes">Accès au texte intégral et bibtex</dt>
+         <dd class="ValeurRes Fichier_joint">
+         <a href="https://inria.hal.science/hal-04068797/file/poster_elodiegermani.pdf"  target="_blank">
+         <img alt="https://inria.hal.science/hal-04068797/file/poster_elodiegermani.pdf" src="https://haltools.archives-ouvertes.fr/images/Haltools_pdf.png" border="0" title="https://inria.hal.science/hal-04068797/file/poster_elodiegermani.pdf" /></a>
+         <span class="LienBibtexACoteFulltext"><a href="https://inria.hal.science/hal-04068797/bibtex" target="_self">
          <img alt="BibTex" src="https://haltools.archives-ouvertes.fr/images/Haltools_bibtex3.png" border="0"  title="BibTex" /></a>
          </span></dd>
          </dl>
@@ -146,14 +169,13 @@ <h2 id="title" class="italic">PhD student</h2>
          <p class='Rubrique'>2020</p>
          <p class='SousRubrique'>Journal articles</p>
          <dl class='NoticeRes'>
-         <dt class="ChampRes">titre</dt><dd class="ValeurRes Titre"><a href="https://hal.science/hal-02994224" target="_blank" >SAPHIR: a Shiny application to analyze tissue section images</a></dd>
+         <dt class="ChampRes">titre</dt><dd class="ValeurRes Titre"><a href="https://dx.doi.org/10.12688/f1000research.27062.2" target="_blank" >SAPHIR: a Shiny application to analyze tissue section images</a></dd>
          <dt class="ChampRes">auteur</dt><dd class="ValeurRes Auteurs">Elodie Germani, Hugues Lelouard, Mathieu Fallet</dd>
-         <dt class="ChampRes">article</dt><dd class="ValeurRes article"><i>F1000Research</i>, 2020, 9, pp.1276. <a target="_blank" href="https://dx.doi.org/10.12688/f1000research.27062.1">&#x27E8;10.12688/f1000research.27062.1&#x27E9;</a></dd>
-         <dt class="ChampRes">DOI</dt><dd class="ValeurRes DOI">DOI : <a href="//dx.doi.org/10.12688/f1000research.27062.1" target="_blank" >10.12688/f1000research.27062.1</a></dd>
+         <dt class="ChampRes">article</dt><dd class="ValeurRes article"><i>F1000Research</i>, 2020, 9, pp.1276. <a target="_blank" href="https://dx.doi.org/10.12688/f1000research.27062.2">&#x27E8;10.12688/f1000research.27062.2&#x27E9;</a></dd>
          <dt class="ChampRes">Accès au texte intégral et bibtex</dt>
          <dd class="ValeurRes Fichier_joint">
-         <a href="https://hal.science/hal-02994224/file/Germani-F1000Res-20.pdf"  target="_blank">
-         <img alt="https://hal.science/hal-02994224/file/Germani-F1000Res-20.pdf" src="https://haltools.archives-ouvertes.fr/images/Haltools_pdf.png" border="0" title="https://hal.science/hal-02994224/file/Germani-F1000Res-20.pdf" /></a>
+         <a href="https://f1000research.com/articles/9-1276/v2/pdf?article_uuid=fd674527-6441-4609-9579-f4a028936a43"  target="_blank">
+         <img alt="https://f1000research.com/articles/9-1276/v2/pdf?article_uuid=fd674527-6441-4609-9579-f4a028936a43" src="https://haltools.archives-ouvertes.fr/images/Haltools_pdf.png" border="0" title="https://f1000research.com/articles/9-1276/v2/pdf?article_uuid=fd674527-6441-4609-9579-f4a028936a43" /></a>
          <span class="LienBibtexACoteFulltext"><a href="https://hal.science/hal-02994224/bibtex" target="_self">
          <img alt="BibTex" src="https://haltools.archives-ouvertes.fr/images/Haltools_bibtex3.png" border="0"  title="BibTex" /></a>
          </span></dd>