Add sterf protocole with export + synthese

[DonovanMaillard]

No description provided.

[lpojgc]

Il semble y avoir un problème sur la gestion des jeux de données, la sélection appliquée dans le paramétrage du module ne se répercute pas sur la saisie de la visite (tous les JDD apparaissent). Je ne vois par contre pas ce qu'il faudrait changer...

[camillemonchicourt]

C'est sûrement car à été ajouté un champs de JDD dans la config des visites qui interroge toute l'API des JDD.
Avec un widget datalist (à éviter de manière générale selon moi).
Il ne faut pas faire ça car les JDD sont gérés nativement par le module Monitoring.

[DonovanMaillard]

hmm. En effet, j'ai testé sans redéfinir la variable id_dasaset dans visit.json et ça fonctionne. Mais c'est surprenant, parce que le module_code est bien défini à partir de la variable du sous-module, donc je m'attendais à ce que ca soit OK .

Dans tous les cas il suffit de supprimer les dernières lignes de visit.json qui concernent id_dataset (ainsi que la virgule au dessus) en conservant les 2 derniers accolades. Je rectifie

[camillemonchicourt]

Petite signature de l'auteur ! 🤣

[DonovanMaillard]

ouais! Mais grâce à ça, tu retrouveras pas ces fichus (je suis poli!) DS_Store de partout

[camillemonchicourt]

Le gars sait compter jusqu'à 33 ! 😍

[DonovanMaillard]

toi non visiblement.... il manque le 8 ❤️

[DonovanMaillard]

(mais c'est volontaire, faut pas le rajouter ;) )

[amandine-sahl]

Pour des questions de performances et de lisibilité, je te conseille:

• d'utiliser directement l'altitude calculé via trigger dans t_base_site
• de grouper les noms des communes en amont pour éviter le group by 1, 2 , ...., i

CREATE OR REPLACE VIEW gn_monitoring.v_export_sterf_standard AS 
   SELECT
   -- identifiant unique
   o.uuid_observation AS uuid_observation,
   -- Site et variables associées
   s.base_site_name AS nom_transect,
   st_astext(s.geom) AS wkt_transect,
   st_x(st_centroid(s.geom_local)) AS x_centroid_local,
   st_y(st_centroid(s.geom_local)) AS y_centroid_local,
   s.altitude_min AS altitude_min,
   s.altitude_max AS altitude_max,
  	com.communes,
   nullif(sc.data::json ->> 'tirage_site', 'null') AS tirage_site,
   nullif(sc.data::json ->> 'habitat_1', 'null') AS habitat_1,
   nullif(sc.data::json ->> 'habitat_2', 'null') AS habitat_2,
   nullif(sc.data::json ->> 'habitat_3', 'null') AS habitat_3,    
   nullif(sc.data::json ->> 'habitat_4', 'null') AS habitat_4,
   -- Informations sur la visite
   v.id_dataset, 
   d.dataset_name AS jeu_de_donnees,
   v.uuid_base_visit AS uuid_visite,
   v.visit_date_min AS date_visite,
   nullif(vc.data::json ->> 'duration', 'null') AS duree_parcours,
   obs.observers,
   nullif(vc.data::json ->> 'start_time', 'null') AS heure_debut,
   nullif(vc.data::json ->> 'meteo_cond', 'null') AS conditions_meteo,
   nullif(vc.data::json ->> 'temperature', 'null') AS temperature,
   nullif(vc.data::json ->> 'vent', 'null') AS vent,
   nullif(vc.data::json ->> 'ennuagement', 'null') AS ennuagement,
   v.comments AS commentaire_visite,
   -- Informations sur l'observation
   o.cd_nom AS cd_nom,
   t.lb_nom AS nom_latin,
   t.nom_vern AS nom_francais,
   r.prenom_role||' '||r.nom_role AS determinateur,
   nullif(oc.data::json ->> 'count_min', 'null') AS count_min,
   nullif(oc.data::json ->> 'count_max', 'null') AS count_max,
   ref_nomenclatures.get_nomenclature_label(nullif(json_extract_path(oc.data::json,'id_nomenclature_determination_method')::text,'null')::integer, 'fr') AS methode_determ,
   o.comments AS commentaire_obs
FROM gn_monitoring.t_observations o
JOIN gn_monitoring.t_observation_complements oc ON oc.id_observation = o.id_observation
JOIN gn_monitoring.t_base_visits v ON o.id_base_visit = v.id_base_visit
JOIN gn_monitoring.t_visit_complements vc ON v.id_base_visit = vc.id_base_visit
JOIN gn_monitoring.t_base_sites s ON s.id_base_site = v.id_base_site
JOIN gn_monitoring.t_site_complements sc ON sc.id_base_site = s.id_base_site
JOIN gn_commons.t_modules m ON m.id_module = v.id_module
JOIN taxonomie.taxref t ON t.cd_nom = o.cd_nom 
LEFT JOIN gn_meta.t_datasets d ON d.id_dataset=v.id_dataset 
LEFT JOIN LATERAL (select string_agg(la.area_name, ', ') AS  communes
   FROM ref_geo.l_areas la
   JOIN ref_geo.bib_areas_types bat ON la.id_type = bat.id_type
   JOIN gn_monitoring.cor_site_area csa ON csa.id_area = la.id_area
   WHERE bat.type_code='COM'
   AND csa.id_base_site = s.id_base_site) AS com ON true
LEFT JOIN LATERAL ( SELECT array_agg(r.id_role) AS ids_observers,
   string_agg(concat(r.nom_role, ' ', r.prenom_role, ' (',org.nom_organisme,') '), ' ; '::text) AS observers
   FROM gn_monitoring.cor_visit_observer cvo
   JOIN utilisateurs.t_roles r ON r.id_role = cvo.id_role
   LEFT JOIN utilisateurs.bib_organismes org ON org.id_organisme =r.id_organisme
   WHERE cvo.id_base_visit = v.id_base_visit) obs ON true
LEFT JOIN utilisateurs.t_roles r ON nullif(json_extract_path(oc.data::json,'determiner')::text,'null')::integer = r.id_role
WHERE m.module_code = 'sterf' 

[amandine-sahl]

Pour que le script se lance il faut utiliser la synthaxe WHERE m.module_code = :module_code