diff --git a/.github/workflows/Build-and-deploy-linux.yml b/.github/workflows/Build-and-deploy-linux.yml
index 6f3482519..7b1dcc58b 100644
--- a/.github/workflows/Build-and-deploy-linux.yml
+++ b/.github/workflows/Build-and-deploy-linux.yml
@@ -17,11 +17,11 @@ jobs:
 
       - uses: actions/setup-python@v2
         with:
-          python-version: 3.9
+          python-version: "3.10"
 
       - uses: conda-incubator/setup-miniconda@v2
         with:
-          activate-environment: env-electron-python
+          activate-environment: nwb-guide
           environment-file: tools/anaconda-env/environment-Linux.yml
           auto-activate-base: false
 
diff --git a/package.json b/package.json
index 9e42d500b..35b4b5c62 100644
--- a/package.json
+++ b/package.json
@@ -15,9 +15,9 @@
     "build:win": "npm run build && npm run build:flask:win && npm run build:electron:win",
     "build:mac": "npm run build && npm run build:flask:unix && npm run build:electron:mac",
     "build:linux": "npm run build && npm run build:flask:unix && npm run build:electron:linux",
-    "build:flask:base": "python -m PyInstaller --name nwb-guide --onedir --clean --noconfirm ./pyflask/app.py --distpath ./build/flask --collect-all nwbinspector --collect-all neuroconv --collect-all pynwb --collect-all hdmf --collect-all ci_info",
+    "build:flask:base": "python -m PyInstaller --name nwb-guide --onedir --clean --noconfirm ./pyflask/app.py --distpath ./build/flask --collect-all nwbinspector --collect-all neuroconv --collect-all pynwb --collect-all hdmf --collect-all ci_info --hidden-import scipy._distributor_init --hidden-import scipy._lib.messagestream --hidden-import scipy._lib._ccallback --hidden-import scipy._lib._testutils",
     "build:flask:win": "npm run build:flask:base -- --add-data ./paths.config.json;. --add-data ./package.json;.",
-    "build:flask:unix": "npm run build:flask:base -- --add-data ./paths.config.json:. --add-data ./package.json:.",
+    "build:flask:unix": "npm run build:flask:base -- --add-data ./paths.config.json:. --add-data ./package.json:. --collect-data jsonschema_specifications",
     "build:electron:win": "electron-builder build --win --publish never",
     "build:electron:mac": "electron-builder build --mac --publish never",
     "build:electron:linux": "electron-builder build --linux --publish never",