Skip to content
New issue

Have a question about this project? Sign up for a free GitHub account to open an issue and contact its maintainers and the community.

By clicking “Sign up for GitHub”, you agree to our terms of service and privacy statement. We’ll occasionally send you account related emails.

Already on GitHub? Sign in to your account

Number of terms, only 400? #79

Open
ramiromagno opened this issue Oct 7, 2023 · 0 comments
Open

Number of terms, only 400? #79

ramiromagno opened this issue Oct 7, 2023 · 0 comments

Comments

@ramiromagno
Copy link

Using the REST API resource https://www.ebi.ac.uk/spot/oxo/api/terms I only get 400 terms. Is that right?

library(oxo)
print(get_terms(), n = Inf)
#> Paginate ■■■■■■■■■■■■■■■                   45% | ETA:  1s
#> Paginate ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■  100% | ETA:  0s
#> # A tibble: 400 × 15
#>     curie         identifier uri   label prefix preferred_prefix idorg_namespace
#>     <chr>         <chr>      <chr> <chr> <chr>  <chr>            <chr>          
#>   1 CHEBI:102097  <NA>       http… (5S,… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>   2 CHEBI:102096  <NA>       http… N-[(… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>   3 CHEBI:102095  <NA>       http… 2-[(… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>   4 CHEBI:102094  <NA>       http… 2-[(… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>   5 CHEBI:102099  <NA>       http… 3-ch… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>   6 CHEBI:102098  <NA>       http… 2-[(… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>   7 CHEBI:141699  <NA>       http… aspi… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>   8 PMID:29109778 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#>   9 CHEBI:141698  <NA>       http… L,L-… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  10 PMID:22852134 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#>  11 PMID:16455044 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#>  12 PMID:12934959 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#>  13 PMID:2105746  <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#>  14 PMID:14980706 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#>  15 PMID:5748939  <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#>  16 CHEBI:189635  <NA>       http… N,O-… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  17 CAS:2009-03-2 <NA>       http… <NA>  CAS    CAS              cas            
#>  18 CHEBI:102086  <NA>       http… N-[(… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  19 CHEBI:102085  <NA>       http… N-[(… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  20 CHEBI:102084  <NA>       http… N-[(… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  21 CHEBI:102083  <NA>       http… LSM-… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  22 CHEBI:102089  <NA>       http… (3S,… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  23 CHEBI:102088  <NA>       http… LSM-… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  24 CHEBI:102087  <NA>       http… (2S,… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  25 CHEBI:175006  <NA>       http… Garc… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  26 HMDB:HMDB002… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#>  27 ChemSpider:2… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#>  28 CHEBI:175005  <NA>       http… Thau… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  29 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#>  30 ChemSpider:9… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#>  31 CHEBI:175004  <NA>       http… Meth… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  32 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#>  33 ChemSpider:3… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#>  34 CHEBI:175003  <NA>       http… 1,2,… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  35 ChemSpider:1… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#>  36 HMDB:HMDB004… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#>  37 CHEBI:175002  <NA>       http… 1,2,… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  38 HMDB:HMDB004… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#>  39 ChemSpider:1… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#>  40 CHEBI:175001  <NA>       http… 4'-H… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  41 ChemSpider:3… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#>  42 HMDB:HMDB004… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#>  43 CHEBI:175000  <NA>       http… 5-Me… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  44 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#>  45 ChemSpider:4… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#>  46 CHEBI:175009  <NA>       http… 4',7… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  47 HMDB:HMDB002… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#>  48 ChemSpider:3… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#>  49 CHEBI:175008  <NA>       http… 6-De… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  50 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#>  51 ChemSpider:1… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#>  52 CHEBI:175007  <NA>       http… 8-De… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  53 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#>  54 ChemSpider:3… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#>  55 CHEBI:102093  <NA>       http… 2-[(… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  56 CHEBI:102092  <NA>       http… 2,2,… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  57 CHEBI:102091  <NA>       http… 2-[(… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  58 CHEBI:102090  <NA>       http… 1-[(… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  59 CHEBI:102075  <NA>       http… LSM-… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  60 CHEBI:102074  <NA>       http… 2-[(… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  61 CHEBI:102073  <NA>       http… N-[(… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  62 CHEBI:102072  <NA>       http… 4-me… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  63 CHEBI:102079  <NA>       http… N-[(… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  64 CHEBI:102078  <NA>       http… N-[(… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  65 CHEBI:102077  <NA>       http… LSM-… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  66 CHEBI:102076  <NA>       http… (2S,… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  67 CHEBI:102082  <NA>       http… N-[(… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  68 CHEBI:102081  <NA>       http… N-[(… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  69 CHEBI:102080  <NA>       http… N-[(… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  70 CHEBI:102064  <NA>       http… N-[(… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  71 CHEBI:102063  <NA>       http… LSM-… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  72 CHEBI:102062  <NA>       http… (2R,… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  73 CHEBI:102061  <NA>       http… 2-[(… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  74 CHEBI:102068  <NA>       http… LSM-… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  75 CHEBI:102067  <NA>       http… 1-[(… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  76 CHEBI:102066  <NA>       http… N-[(… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  77 CHEBI:102065  <NA>       http… 2-[(… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  78 CHEBI:102069  <NA>       http… N-[(… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  79 CHEBI:102071  <NA>       http… N-[(… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  80 CHEBI:102070  <NA>       http… LSM-… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  81 CHEBI:141669  <NA>       http… stap… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  82 MetaCyc:CPD-… <NA>       <NA>  <NA>  MetaC… MetaCyc          <NA>           
#>  83 CHEBI:175075  <NA>       http… Dihy… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  84 ChemSpider:2… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#>  85 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#>  86 CHEBI:175074  <NA>       http… Myco… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  87 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#>  88 CAS:71339-45… <NA>       http… <NA>  CAS    CAS              cas            
#>  89 ChemSpider:4… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#>  90 CHEBI:175073  <NA>       http… 3,3'… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  91 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#>  92 ChemSpider:2… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#>  93 CHEBI:175072  <NA>       http… D-Li… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  94 ChemSpider:8… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#>  95 CHEBI:175071  <NA>       http… (S)-… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  96 HMDB:HMDB002… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#>  97 CHEBI:175070  <NA>       http… 5'-H… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#>  98 HMDB:HMDB004… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#>  99 ChemSpider:3… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 100 CHEBI:175079  <NA>       http… 2-Hy… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 101 HMDB:HMDB004… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 102 ChemSpider:3… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 103 CHEBI:175078  <NA>       http… (S,E… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 104 CAS:7645-23-0 <NA>       http… <NA>  CAS    CAS              cas            
#> 105 ChemSpider:4… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 106 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 107 CHEBI:175077  <NA>       http… Tryp… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 108 ChemSpider:1… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 109 CHEBI:175076  <NA>       http… Musa… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 110 ChemSpider:8… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 111 HMDB:HMDB004… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 112 CHEBI:175086  <NA>       http… Eugl… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 113 ChemSpider:9… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 114 CHEBI:175085  <NA>       http… Eugl… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 115 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 116 ChemSpider:8… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 117 CHEBI:175084  <NA>       http… Eugl… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 118 ChemSpider:3… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 119 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 120 CHEBI:175083  <NA>       http… 4-p-… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 121 HMDB:HMDB002… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 122 ChemSpider:3… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 123 CHEBI:175082  <NA>       http… 3-p-… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 124 HMDB:HMDB002… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 125 ChemSpider:3… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 126 CHEBI:175081  <NA>       http… 6-Hy… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 127 ChemSpider:3… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 128 HMDB:HMDB004… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 129 CHEBI:175080  <NA>       http… 4-Hy… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 130 HMDB:HMDB004… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 131 ChemSpider:3… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 132 CHEBI:175089  <NA>       http… D-Fr… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 133 ChemSpider:1… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 134 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 135 CHEBI:175088  <NA>       http… Isom… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 136 ChemSpider:2… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 137 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 138 CHEBI:175087  <NA>       http… Heli… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 139 ChemSpider:2… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 140 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 141 CHEBI:175053  <NA>       http… (6be… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 142 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 143 ChemSpider:3… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 144 CHEBI:175052  <NA>       http… 3-(3… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 145 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 146 ChemSpider:1… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 147 CHEBI:175051  <NA>       http… 1,3,… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 148 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 149 ChemSpider:3… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 150 CHEBI:175050  <NA>       http… 3,4'… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 151 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 152 ChemSpider:4… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 153 CHEBI:175059  <NA>       http… 5,7-… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 154 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 155 ChemSpider:3… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 156 CHEBI:175058  <NA>       http… 5,8-… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 157 ChemSpider:1… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 158 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 159 CHEBI:175057  <NA>       http… repa… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 160 ChemSpider:2… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 161 HMDB:HMDB006… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 162 CHEBI:175056  <NA>       http… Armi… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 163 CAS:135247-9… <NA>       http… <NA>  CAS    CAS              cas            
#> 164 ChemSpider:1… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 165 CHEBI:175055  <NA>       http… Meli… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 166 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 167 ChemSpider:4… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 168 CHEBI:175054  <NA>       http… Meli… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 169 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 170 ChemSpider:2… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 171 CHEBI:40035   <NA>       http… 4-me… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 172 PMID:24161    <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 173 PMID:16180012 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 174 PMID:2079523  <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 175 KEGG:C19262   <NA>       <NA>  <NA>  KEGG   KEGG             <NA>           
#> 176 CAS:822-36-6  <NA>       http… <NA>  CAS    CAS              cas            
#> 177 PMID:17619857 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 178 PMID:2254202  <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 179 CHEBI:175064  <NA>       http… Viol… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 180 ChemSpider:2… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 181 CHEBI:175063  <NA>       http… Pers… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 182 ChemSpider:5… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 183 CHEBI:175062  <NA>       http… Arto… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 184 HMDB:HMDB004… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 185 ChemSpider:2… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 186 CHEBI:175061  <NA>       http… 4',7… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 187 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 188 ChemSpider:2… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 189 CHEBI:175060  <NA>       http… 3',5… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 190 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 191 ChemSpider:2… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 192 CHEBI:175069  <NA>       http… 7-Hy… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 193 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 194 ChemSpider:2… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 195 CHEBI:175068  <NA>       http… 7-Hy… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 196 ChemSpider:3… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 197 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 198 CHEBI:175067  <NA>       http… Veri… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 199 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 200 ChemSpider:2… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 201 CHEBI:175066  <NA>       http… Veri… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 202 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 203 ChemSpider:2… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 204 CHEBI:175031  <NA>       http… 5,8-… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 205 ChemSpider:3… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 206 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 207 CHEBI:175030  <NA>       http… 2,3,… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 208 ChemSpider:9… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 209 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 210 CHEBI:175039  <NA>       http… 6-Hy… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 211 HMDB:HMDB004… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 212 ChemSpider:3… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 213 CHEBI:175038  <NA>       http… 6'-H… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 214 ChemSpider:3… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 215 HMDB:HMDB004… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 216 CHEBI:175037  <NA>       http… 5-Hy… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 217 HMDB:HMDB004… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 218 ChemSpider:3… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 219 CHEBI:175036  <NA>       http… 4-Hy… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 220 HMDB:HMDB004… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 221 ChemSpider:9… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 222 CHEBI:175035  <NA>       http… 4'-H… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 223 HMDB:HMDB004… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 224 ChemSpider:8… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 225 CHEBI:175034  <NA>       http… 2-Hy… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 226 HMDB:HMDB004… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 227 ChemSpider:3… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 228 CHEBI:175033  <NA>       http… 2'-H… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 229 HMDB:HMDB004… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 230 ChemSpider:3… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 231 CHEBI:175042  <NA>       http… (+)-… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 232 HMDB:HMDB002… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 233 ChemSpider:3… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 234 CHEBI:175041  <NA>       http… Litc… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 235 ChemSpider:3… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 236 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 237 CHEBI:175040  <NA>       http… 7-Hy… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 238 ChemSpider:2… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 239 CHEBI:175049  <NA>       http… Code… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 240 DrugBank:DB0… <NA>       http… <NA>  DrugB… DrugBank         drugbank       
#> 241 ChemSpider:4… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 242 CHEBI:175048  <NA>       http… N-Di… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 243 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 244 ChemSpider:1… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 245 CHEBI:175047  <NA>       http… Eryt… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 246 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 247 ChemSpider:5… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 248 CHEBI:175045  <NA>       http… Oblo… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 249 ChemSpider:1… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 250 HMDB:HMDB004… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 251 CHEBI:175044  <NA>       http… Peri… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 252 ChemSpider:2… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 253 CAS:141206-2… <NA>       http… <NA>  CAS    CAS              cas            
#> 254 CHEBI:175043  <NA>       http… T2 T… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 255 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 256 ChemSpider:5… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 257 CHEBI:29681   <NA>       http… surf… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 258 PMID:22511326 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 259 PMID:18709634 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 260 PMID:21958007 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 261 PMID:21435848 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 262 PMID:20545293 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 263 PMID:8339332  <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 264 PMID:8004708  <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 265 PMID:23265790 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 266 PMID:16294001 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 267 PMID:21446656 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 268 PMID:22629294 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 269 PMID:22878634 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 270 PMID:21626642 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 271 PMID:20828112 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 272 CHEBI:175017  <NA>       http… 4',5… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 273 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 274 ChemSpider:2… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 275 CHEBI:175016  <NA>       http… Di-4… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 276 CAS:364048-9… <NA>       http… <NA>  CAS    CAS              cas            
#> 277 ChemSpider:3… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 278 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 279 CHEBI:175015  <NA>       http… Musc… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 280 ChemSpider:1… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 281 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 282 CHEBI:29689   <NA>       http… Telo… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 283 KEGG:C12040   <NA>       <NA>  <NA>  KEGG   KEGG             <NA>           
#> 284 CHEBI:175014  <NA>       http… 3,4-… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 285 ChemSpider:3… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 286 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 287 CHEBI:175013  <NA>       http… 4',5… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 288 ChemSpider:2… <NA>       http… <NA>  ChemS… ChemSpider       chemspider     
#> 289 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 290 CHEBI:175012  <NA>       http… Mang… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 291 KEGG:C10766   <NA>       <NA>  <NA>  KEGG   KEGG             <NA>           
#> 292 CHEBI:488     <NA>       http… 1,2-… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 293 KNApSAcK:C00… <NA>       http… <NA>  KNApS… KNApSAcK         knapsack       
#> 294 KEGG:C02108   <NA>       <NA>  <NA>  KEGG   KEGG             <NA>           
#> 295 CHEBI:2879    <NA>       http… Aspe… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 296 KEGG:C10571   <NA>       <NA>  <NA>  KEGG   KEGG             <NA>           
#> 297 KNApSAcK:C00… <NA>       http… <NA>  KNApS… KNApSAcK         knapsack       
#> 298 CAS:490-02-8  <NA>       http… <NA>  CAS    CAS              cas            
#> 299 CHEBI:2885    <NA>       http… Aspi… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 300 CAS:2122-25-0 <NA>       http… <NA>  CAS    CAS              cas            
#> 301 KEGG:C09038   <NA>       <NA>  <NA>  KEGG   KEGG             <NA>           
#> 302 CHEBI:2884    <NA>       http… Aspi… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 303 KEGG:C10673   <NA>       <NA>  <NA>  KEGG   KEGG             <NA>           
#> 304 KNApSAcK:C00… <NA>       http… <NA>  KNApS… KNApSAcK         knapsack       
#> 305 CAS:519-40-4  <NA>       http… <NA>  CAS    CAS              cas            
#> 306 CHEBI:2883    <NA>       http… Aspi… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 307 CAS:584-28-1  <NA>       http… <NA>  CAS    CAS              cas            
#> 308 KNApSAcK:C00… <NA>       http… <NA>  KNApS… KNApSAcK         knapsack       
#> 309 KEGG:C10672   <NA>       <NA>  <NA>  KEGG   KEGG             <NA>           
#> 310 CHEBI:2882    <NA>       http… Aspe… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 311 KEGG:C11655   <NA>       <NA>  <NA>  KEGG   KEGG             <NA>           
#> 312 CHEBI:2888    <NA>       http… Aspi… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 313 CAS:5794-14-9 <NA>       http… <NA>  CAS    CAS              cas            
#> 314 KEGG:C09041   <NA>       <NA>  <NA>  KEGG   KEGG             <NA>           
#> 315 CHEBI:2887    <NA>       http… Aspi… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 316 CAS:2348-67-6 <NA>       http… <NA>  CAS    CAS              cas            
#> 317 KEGG:C09040   <NA>       <NA>  <NA>  KEGG   KEGG             <NA>           
#> 318 CHEBI:2886    <NA>       http… Aspi… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 319 CAS:2744-47-0 <NA>       http… <NA>  CAS    CAS              cas            
#> 320 KEGG:C09039   <NA>       <NA>  <NA>  KEGG   KEGG             <NA>           
#> 321 CHEBI:2881    <NA>       http… aspe… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 322 PMID:4391591  <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 323 PMID:5815526  <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 324 KNApSAcK:C00… <NA>       http… <NA>  KNApS… KNApSAcK         knapsack       
#> 325 PMID:17396882 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 326 PMID:14915952 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 327 KEGG:C09769   <NA>       <NA>  <NA>  KEGG   KEGG             <NA>           
#> 328 PMID:14220867 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 329 CAS:14259-45… <NA>       http… <NA>  CAS    CAS              cas            
#> 330 PMID:14220877 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 331 CHEBI:2880    <NA>       http… aspe… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 332 KEGG:C11688   <NA>       <NA>  <NA>  KEGG   KEGG             <NA>           
#> 333 CAS:93413-04… <NA>       http… <NA>  CAS    CAS              cas            
#> 334 KNApSAcK:C00… <NA>       http… <NA>  KNApS… KNApSAcK         knapsack       
#> 335 CHEBI:479     <NA>       http… 1,2,… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 336 CAS:132023-5… <NA>       http… <NA>  CAS    CAS              cas            
#> 337 KEGG:C10243   <NA>       <NA>  <NA>  KEGG   KEGG             <NA>           
#> 338 KNApSAcK:C00… <NA>       http… <NA>  KNApS… KNApSAcK         knapsack       
#> 339 CHEBI:470     <NA>       http… 1'-a… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 340 CAS:53890-24… <NA>       http… <NA>  CAS    CAS              cas            
#> 341 KEGG:C10427   <NA>       <NA>  <NA>  KEGG   KEGG             <NA>           
#> 342 PMID:25464007 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 343 PMID:23266278 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 344 KNApSAcK:C00… <NA>       http… <NA>  KNApS… KNApSAcK         knapsack       
#> 345 CHEBI:2894    <NA>       http… imaz… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 346 PMID:17320147 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 347 KEGG:C11083   <NA>       <NA>  <NA>  KEGG   KEGG             <NA>           
#> 348 CAS:81405-85… <NA>       http… <NA>  CAS    CAS              cas            
#> 349 PMID:22565269 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 350 PMID:23219405 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 351 HMDB:HMDB003… <NA>       http… <NA>  HMDB   HMDB             hmdb           
#> 352 CHEBI:2899    <NA>       http… tran… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 353 PMID:10457456 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 354 PMID:20113506 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 355 PMID:11962253 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 356 KNApSAcK:C00… <NA>       http… <NA>  KNApS… KNApSAcK         knapsack       
#> 357 CAS:29884-49… <NA>       http… <NA>  CAS    CAS              cas            
#> 358 PMID:10552542 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 359 KEGG:C10245   <NA>       <NA>  <NA>  KEGG   KEGG             <NA>           
#> 360 PMID:21865488 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 361 PMID:21487710 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 362 PMID:23624538 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 363 PMID:23150460 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 364 PMID:22144103 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 365 PMID:15998130 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 366 CHEBI:2898    <NA>       http… Astr… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 367 KEGG:C08925   <NA>       <NA>  <NA>  KEGG   KEGG             <NA>           
#> 368 KNApSAcK:C00… <NA>       http… <NA>  KNApS… KNApSAcK         knapsack       
#> 369 CAS:101843-8… <NA>       http… <NA>  CAS    CAS              cas            
#> 370 CHEBI:2897    <NA>       http… astr… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 371 KEGG:C08924   <NA>       <NA>  <NA>  KEGG   KEGG             <NA>           
#> 372 CAS:84687-42… <NA>       http… <NA>  CAS    CAS              cas            
#> 373 PMID:22902230 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 374 KNApSAcK:C00… <NA>       http… <NA>  KNApS… KNApSAcK         knapsack       
#> 375 CHEBI:93909   <NA>       http… 2,5,… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 376 CHEBI:93911   <NA>       http… 5-[a… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 377 CHEBI:93910   <NA>       http… N-[4… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 378 CHEBI:93915   <NA>       http… 4-[o… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 379 CHEBI:93914   <NA>       http… 1-[1… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 380 CHEBI:93913   <NA>       http… 2-(6… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 381 CHEBI:93912   <NA>       http… 2-[[… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 382 CHEBI:93919   <NA>       http… LSM-… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 383 CHEBI:93918   <NA>       http… 2-[2… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 384 CHEBI:93917   <NA>       http… 1-(9… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 385 CHEBI:93916   <NA>       http… 5-[2… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 386 CHEBI:2841    <NA>       http… Arom… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 387 KEGG:C11443   <NA>       <NA>  <NA>  KEGG   KEGG             <NA>           
#> 388 CHEBI:2840    <NA>       http… Arom… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 389 KEGG:C11442   <NA>       <NA>  <NA>  KEGG   KEGG             <NA>           
#> 390 CHEBI:2842    <NA>       http… Arom… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 391 KNApSAcK:C00… <NA>       http… <NA>  KNApS… KNApSAcK         knapsack       
#> 392 KEGG:C06514   <NA>       <NA>  <NA>  KEGG   KEGG             <NA>           
#> 393 CHEBI:68896   <NA>       http… caly… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 394 PMID:21992192 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 395 CHEBI:68895   <NA>       http… 24-e… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 396 CHEBI:68894   <NA>       http… Grah… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 397 PMID:22047009 <NA>       <NA>  <NA>  PMID   PMID             <NA>           
#> 398 CHEBI:68893   <NA>       http… Grah… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 399 CHEBI:93900   <NA>       http… LSM-… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> 400 CHEBI:68899   <NA>       http… caly… CHEBI  CHEBI            <NA>           
#> # ℹ 8 more variables: alternate_prefix <list>, alternate_iris <list>,
#> #   name <chr>, orcid <chr>, description <chr>, source <chr>, licence <chr>,
#> #   version_info <chr>

Created on 2023-10-07 with reprex v2.0.2

Sign up for free to join this conversation on GitHub. Already have an account? Sign in to comment
Labels
None yet
Projects
None yet
Development

No branches or pull requests

1 participant